蛋白表达水平的分析: 结果文件展示: 1.all_sample.fa 所有鉴定到蛋白的序列文件 2.all_sample.xls 所有鉴定到蛋白的定量结果 3.Pep_pro.xlsx 蛋白与肽段鉴定信息 =========================================================================== 表头说明: 1.all_sample.xls: protein 鉴定到蛋白序列的ID Description 蛋白描述 Gene 蛋白对应的基因名称 注:Gene后面的列为不同样品的表达情况; 2.Pep_pro.xlsx表中Peptide/Proteins表的表头信息注释 Peptide Sequence:肽段氨基酸序列 Modifications:修饰类型及位点 Master Protein Accessions:master protein 的特征性编号 Missed Cleavages:酶漏切位点数目 PSMs:该肽段包含的肽段匹配数目 RT [min]:保留时间 DeltaM[ppm]:质量测量准确度,是质谱定性的重要依据。 其计算方法:|M-M0|÷m)×10^6(ppm) 注:M为离子质量的实测值;M0为离子质量的理论值;m为离子的质量数。 对于高分辨率质谱通常要求仪器的质量测量准确度小于10ppm。 Abundances (Normalized):该肽段的丰度标准化,校正实验偏差 Proteins Accession:蛋白ID MW [kDa]:蛋白分子量 Coverage [%]:蛋白序列中氨基酸覆盖度 PSMs:肽段匹配到二级谱图的数目 Peptides:鉴定到不同肽段的总数目 Unique Peptides:特异性肽段数目 Score 对蛋白匹配度的打分,是肽段分数的加和,分数越高可信度越高 Abundances (Normalized):该蛋白的丰度标准化,校正实验偏差